V akademickom publikovaní je vedecký časopis periodická publikácia, ktorej cieľom je podporovať pokrok vedy, zvyčajne informovaním o novom výskume. Väčšina časopisov je úzko špecializovaná, hoci niektoré z najstarších časopisov, ako napríklad Nature, uverejňujú články a vedecké práce zo širokého spektra vedeckých oblastí. Vedecké časopisy obsahujú články, ktoré prešli odbornou recenziou, ktorej cieľom je zabezpečiť, aby články spĺňali normy kvality a vedeckej platnosti časopisu. Hoci sa vedecké časopisy na prvý pohľad podobajú časopisom, v skutočnosti sú úplne odlišné. Vydania vedeckých časopisov sa málokedy čítajú náhodne, ako sa čítajú časopisy. Články sa píšu ako súčasť vedeckej metódy; vo všeobecnosti musia poskytovať dostatok podrobností o experimente, aby nezávislý výskumník mohol experiment prípadne zopakovať a overiť výsledky. Takéto články v časopisoch sa považujú za súčasť trvalého vedeckého záznamu.
Normy, ktoré časopis používa na určenie publikácie, sa môžu značne líšiť. Niektoré časopisy, ako napríklad Nature, Science, PNAS alebo Physical Review Letters, neuverejnia článok, ak sa nedomnievajú, že predstavuje zásadný prielom v danej oblasti, a preto odmietajú články, ktoré obsahujú dobrú prácu, ktorá nespĺňa toto kritérium. V mnohých oblastiach existuje neformálna hierarchia vedeckých časopisov; najprestížnejší časopis v danej oblasti býva najselektívnejší, pokiaľ ide o články, ktoré vyberie na uverejnenie. Bežné je aj regionálne zameranie časopisov, ktoré sa špecializujú na uverejňovanie článkov z určitého geografického regiónu.
Články sú zvyčajne vysoko odborné a predstavujú najnovšie výsledky teoretického výskumu a experimentov v oblasti vedy, ktorej sa časopis venuje. Často sú nezrozumiteľné pre kohokoľvek okrem výskumníkov v danej oblasti. Vedecké časopisy sú dôležitou súčasťou vedeckej literatúry.
Existuje niekoľko typov článkov v časopisoch; presná terminológia a definície sa líšia v závislosti od oblasti a konkrétneho časopisu, ale často zahŕňajú:
Formáty článkov v časopisoch sa líšia, ale takmer vždy sa riadia nasledujúcou všeobecnou schémou. Začínajú sa abstraktom, čo je jedno- až štvorodstavcové zhrnutie článku. V úvode sa opisuje pozadie výskumu vrátane diskusie o podobných výskumoch. V časti o materiáloch a metódach alebo o experimente sa uvádzajú konkrétne podrobnosti o tom, ako sa výskum uskutočnil. V časti výsledky a diskusia sa opisujú výsledky a dôsledky výskumu a v časti záver sa výskum uvádza do kontextu a opisujú sa možnosti ďalšieho skúmania.
Okrem toho niektoré vedecké časopisy, ako napríklad Science, obsahujú sekciu správ, v ktorej sa opisuje vedecký vývoj (často zahŕňajúci politické otázky). Tieto články často píšu vedeckí novinári a nie vedci. Okrem toho niektoré časopisy obsahujú redakčnú časť a časť pre listy redakcii. Hoci ide o články uverejnené v rámci časopisu, vo všeobecnosti sa nepovažujú za vedecké články, pretože neboli recenzované.
Tvrdí sa, že recenzované papierové časopisy sú v procese nahrádzania elektronickým publikovaním.
K uverejneniu článku v časopise dochádza zvyčajne s niekoľkomesačným oneskorením, a preto časopisy nie sú ideálnym formátom na šírenie najnovšieho výskumu. V niektorých oblastiach, ako je napríklad astronómia, úlohu časopisu pri šírení najnovšieho výskumu do veľkej miery nahradili databázy preprintov, ako je napríklad arXiv.org. Vedecké časopisy však stále zohrávajú dôležitú úlohu pri kontrole kvality, archivácii dokumentov a vytváraní vedeckého kreditu. Vo všeobecnosti platí, že elektronické materiály nahrané do databáz preprintov sú stále určené na prípadné uverejnenie v recenzovanom časopise.
Ďalším sporom sú náklady na vedecké časopisy. Mnohí vedci a knihovníci protestujú proti nákladom na časopisy, najmä keď vidia, že tieto poplatky idú do veľkých ziskových vydavateľstiev. Veľkú diskusiu vyvoláva aj skutočnosť, že autorské práva sú pridelené vydavateľovi časopisu, a nie autorom.
Existuje článok s názvom „Online alebo neviditeľný?“ (pozri nižšie), ktorý používa štatistické argumenty na tvrdenie, že elektronické publikovanie poskytuje širšie šírenie. Viaceré časopisy pri zachovaní recenzného konania zaviedli elektronické verzie alebo dokonca úplne prešli na elektronické publikovanie.